La vitamine B15 est facilement absorbée par les intestins et pénètre dans le foie avec la circulation sanguine. À la suite de réactions biochimiques, il est d'abord converti en sarcosine, puis en glycine. Sous forme inchangée, l'acide pangamique est transporté par le sang vers tous les organes et tissus, où il participe aux réactions de formation de phosphate de créatine et de glycogène dans les tissus musculaires, et est impliqué dans la formation de protéines, de graisses et de glucides.
L'excrétion de la vitamine B15 se produit inchangée par les reins et les intestins. Il ne s'accumule pas dans l'organisme, la toxicité de l'acide pangamique et de ses métabolites est faible.
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